有负债的公司不能直接注销，这是基于多方面原因的，以下为你详细分析：
一、清算要求
我国《公司法》明确规定，公司在注销前必须经过清算程序。
清算工作至关重要，它涉及到对公司财产的全面梳理。
首先，要分别编制详细的资产负债表和财产清单，让公司的财务状况一目了然。
其次，要通过合理的方式通知、公告债权人，确保他们知晓公司即将注销的情况。
同时，还要处理与清算有关的公司未了结的业务，另外，清缴所欠税款以及清算过程中产生的税款也是必不可少的环节，最后还要对债权、债务进行仔细清理。
二、债务处理
公司在清算时，要对负债妥善安排。
若公司财产足以清偿债务，需按照法定顺序依次清偿。
先是支付清算过程中产生的各项费用，接着要保障职工的权益，支付职工工资、社会保险费用和法定补偿金。
之后，缴纳所欠税款，再清偿公司的其他债务。
而如果公司资不抵债，也就是公司的资产无法偿还全部债务时，就应当依法向人民法院申请宣告破产，通过破产程序来处理债务问题。
三、法律后果
若有负债的公司未经合法清算程序就直接注销，这会给债权人带来极大的损失。
因为债权人可能无法顺利收回自己的债权。
同时，相关责任人可能需要承担相应的法律责任，面临法律的制裁。

案情回顾:

小朱、小李、小胡三人共同成立了一家公司，后公司经营不善产生负债。小朱主张直接注销公司，小李和小胡认为有负债不能直接注销，应先清算处理债务，双方就此产生争议。最终小朱一意孤行直接注销了公司，引发系列问题。

案情分析:

1、从清算要求看，公司注销前应按规定编制资产负债表等，通知债权人、处理未了结业务、清缴税款等，小朱直接注销违反了这些法定程序。
2、就债务处理而言，公司有负债应妥善安排，财产足以偿债按法定顺序清偿，资不抵债应申请破产，小朱行为未对债务作合法处理。
3、从法律后果讲，小朱未经合法清算注销公司，可能使债权人无法收回债权，相关责任人或要承担法律责任。