1、设立的基础不同。公司的设立以章程为基础。而合伙的成立则建立在合伙合同的基础上，合伙合同是全体出资人意思表示一致达成的协议，他只对合伙的参加人，即合伙合同的订立者有约束力。
2、法律地位不同。公司与合伙企业最根本的区别在于，两者具有不同的法律地位。根据我国《合伙企业法》的规定，合伙企业不具有法人资格。我国《公司法》规定，有限责任公司和股份有限公司是企业法人。
3、合伙企业与公司内部及外部法律关系上也具有实质性差异。

《公司法》第三条
公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。
有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任;股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。