专利合同备案需提交的文件包括：
专利实施许可合同备案申请表、具有许可双方签字或盖章的专利实施许可合同原件或者经公证机构公证的复印件、许可人与被许可人的相关身份证明以及法律规定的其他专利合同备案需提交的文。

《中华人民共和国专利法实施细则》第十四条
除依照专利法第十条规定转让专利权外，专利权因其他事由发生转移的，当事人应当凭有关证明文件或者法律文书向国务院专利行政部门办理专利权转移手续。
专利权人与他人订立的专利实施许可合同，应当自合同生效之日起3个月内向国务院专利行政部门备案。
以专利权出质的，由出质人和质权人共同向国务院专利行政部门办理出质登记。