故意伤害残疾等级鉴定程序是：
1、被害人申请案件主办单位（公安机关）进行伤情鉴定，受害人提供相关鉴定材料；
2、公安机关委托法医或者鉴定机构办理；
3、鉴定机构对被鉴定人提供的病历资料真实性，并在病历资料复印件上盖章确认；
4、鉴定机构调查确认当事人存在被伤害的客观事实，出具伤情鉴定委托书。

《刑法》第二百三十四条
故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。