通常来讲，倘若员工进入了诈骗公司，那么他们极有可能会被当作从犯来对待。
要是员工明明知晓公司在进行诈骗活动，却依然参与其中，那么他们就很可能会遭遇到刑事处罚。
依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，当诈骗公私财物的行为发生，且数额达到较大程度时，犯罪者将会被判处三年以下的有期徒刑、拘役或者管制，同时还需要并处或者单处罚金；要是数额极为巨大或者存在其他较为严重的情节，那么犯罪者就会被判处三年以上十年以下的有期徒刑，并且要进行处罚金；倘若数额特别巨大或者存在其他特别严重的情节，犯罪者将会被判处十年以上的有期徒刑或者无期徒刑，并且要处罚金或者没收财产。
如果员工能够有力地证明自己仅仅是一名普通员工，对公司的诈骗行为毫不知情，并且在案件发生之后能够积极主动地配合相关调查工作，如实供述自己所犯下的罪行，那么在这种情况下，他们就有可能获得从轻或者减轻处罚的机会。
总而言之，进入了诈骗公司的员工必须要尽快脱离那个危险的环境，并且积极配合司法机关的调查工作，以此来争取能够得到从轻处理的结果。

案情回顾:

小朱进入一家公司工作，之后发现公司涉嫌诈骗活动，但小李仍继续工作。公司诈骗数额较大被查处，小朱称自己不知情且积极配合调查，小李则被认为是参与其中。对于小朱是否真不知情，小胡（检察官）与小丽（小朱律师）存在争议。

案情分析:

1、若小朱能证明自己确实不知情，根据法律规定，他积极配合调查，有从轻或减轻处罚的可能。
2、若小朱其实知情却声称不知，那他也可能被当作从犯对待，面临刑事处罚，具体处罚程度要依据诈骗数额等情节判定。