公司进行网络诈骗会被立案调查。
涉案的员工会受到刑事的调查，若是涉案的员工确实是存在犯罪的事实，会被立案调查，案件进入司法程序。
若经过调查发现没有犯罪的事实，与公司犯罪的行为的没有关联的，那么是不会受到牵连的。
如果公司犯罪事实确实存在，公司可能会被注销或者相关业务被停顿，主要管理人员被司法机关控制，往往无辜员工的工资也会被拖欠下去。

《中华人民共和国刑法》第二百六十六条
【诈骗罪】诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；
数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；
数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。本法另有规定的，依照规定。