即便是犯罪嫌疑人矢口否认实施了强奸行为，但只要有充足且确凿的证据能够证实其所犯下的罪行，那么他仍将会面临法律的制裁和刑事处罚。
这些所谓的证据既可以是受害者本人具备充分说服力的陈述、其他知情人提供有力的证词，也可以是诸如现场遗留下来的物品、检验机构出具的科学评估报告等等。
在这样的前提下，法庭应该根据各类证据进行全面性的分析和整合，最终以是否达到了强奸罪所要求的证明标准为参考，做出相应的确立或否定的判断。
此外，值得特别指出的是，在司法实践操作过程中，我们绝对不能仅依据某人的坚决否认来匆忙地宣告他清白无辜，这种做法常常会导致误判或者冤案发生。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条
【重证据、重调查研究、不轻信口供原则】对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。