关于取保候审保证金的没收流程，它的具体操作是由行使决定权的部门来完成的。
在大部分情况下，若被取保候审者未能遵守相关规定，例如未经中止执行措施的机关批准自行离开所居住的城市或县城，或者在被传唤的时候未能按时出面应讯等等情况发生时，负责执行的机关应当上报给作出决定取保候审的上一级部门，以待后者基于实际情况作出是否没收保证金的决断。
值得注意的是，当有关部门决定没收保证金时，必须履行严格的审查与审批手续，以确保其合法性；
另外，还要制作《没收保证金决定书》并将之送达到被保释人和为其提供保证金的机构或人员那里，以便他们知晓没收保证金的原因以及相应的法律依据。
最后，对于收到没收保证金决定书的被取保候审人来说，他们仍享有权利可以在规定期限内向上级部门提出申诉；
而对于相关的机构或人员而言，他们有权利就没收保证金的决定开展复审。