若行为人因妨害公务罪被批准进行取保候审，但在法院经过深入审查之后，如发现有足够证据证明其确实施了犯罪行为，那么仍需接受刑事处罚。在此过程中，取保候审与审判程序相互独立并行，仅当符合相关法律规定的取保候审条件时，方可获得取保候审的资格。
然而，这并不代表行为人不构成犯罪或者不会面临刑事判决。

《中华人民共和国刑法》第二百七十七条
以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。
以暴力、威胁方法阻碍全国人民代表大会和地方各级人民代表大会代表依法执行代表职务的，依照前款的规定处罚。
在自然灾害和突发事件中，以暴力、威胁方法阻碍红十字会工作人员依法履行职责的，依照第一款的规定处罚。
故意阻碍国家安全机关、公安机关依法执行国家安全工作任务，未使用暴力、威胁方法，造成严重后果的，依照第一款的规定处罚。
暴力袭击正在依法执行职务的人民警察的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；使用枪支、管制刀具，或者以驾驶机动车撞击等手段，严重危及其人身安全的，处三年以上七年以下有期徒刑。