公诉转自诉案件其实是对公安机关，检察院行为的一种审查，是一种监督纠错机制。
它本质上仍是公诉案件，只是赋予被害人自诉的救济权利，因此是不允许调解的，除了民事赔偿部分。
但是根据法律相关规定，可以进行和解。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十八条
下列公诉案件，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪，通过向被害人赔偿损失、赔礼道歉等方式获得被害人谅解，被害人自愿和解的，双方当事人可以和解：
(一)因民间纠纷引起，涉嫌刑法分则第四章、第五章规定的犯罪案件，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的；
(二)除渎职犯罪以外的可能判处七年有期徒刑以下刑罚的过失犯罪案件。
犯罪嫌疑人、被告人在五年以内曾经故意犯罪的，不适用本章规定的程序。