在办理拆迁房公证处公证协议时，有以下几个方面需要特别注意：
一、协议主体资格
签订协议的各方主体必须具备相应的民事行为能力和权利能力。
对于拆迁方而言，要有合法的拆迁资质，这是确保拆迁行为合法有效的前提。
相关部门颁发的拆迁许可证等文件，是其资质的重要证明。
而被拆迁方应是房屋的合法所有权人或使用权人，需要提供如房产证、租赁合同等相关证明材料，以证实其对房屋的合法权益。
二、协议内容完整性
协议要详细明确拆迁房屋的具体信息，包括准确的位置、实际面积等。
补偿方式是关键内容，若选择货币补偿，要明确补偿金额的具体数额；若为安置房屋补偿，则需说明安置房屋的位置、面积、户型等具体情况。
同时，补偿款的支付时间、安置房屋的交付时间等条款也要清晰准确，避免后续产生纠纷。
三、合法性审查
协议内容必须符合法律法规的规定，补偿标准不得低于法定最低标准。
例如，当地政府根据相关政策制定的拆迁补偿标准，是协议补偿内容的重要参考依据，任何违反规定的条款都可能导致协议无效。
四、证据准备
办理公证时，要携带与拆迁房屋相关的产权证明、身份证明等必要材料。
这些材料是公证处核实相关情况的重要依据，确保协议的真实性和合法性。
五、自愿公平
协议必须是各方真实意思的体现，不存在欺诈、胁迫等不正当情形，以保障各方的合法权益。

案情回顾:

小朱作为拆迁方，在与被拆迁方小李办理拆迁房公证处公证协议时，小朱无法提供拆迁许可证，且协议中房屋面积记载模糊，补偿款支付时间未明确。小李认为小朱主体资格存疑且协议内容不完整，不愿继续办理公证，双方产生争议。

案情分析:

1、关于协议主体资格，小朱缺乏合法拆迁资质证明，不具备相应主体资格，可能导致拆迁行为无效。
2、协议内容完整性方面，房屋信息不准确、补偿款支付时间不明，易引发后续纠纷，不符合公证要求。
3、合法性审查上，因主体和内容问题，可能存在违反法规情况，影响协议效力。
4、证据准备不足，缺少关键资质证明，公证处难以核实情况。
5、若小朱存在隐瞒资质问题等情况，则违反自愿公平原则，损害小李权益。