由政府作出确权决定。

宅基地确权，必须由政府处理，由政府作出确权决定。
法院只对宅基地侵权纠纷有管辖权，对宅基地确权纠纷没有直接管辖权。
当事人任何一方或双方可到当地乡(镇)政府或土地管理所等受理机关提出处理申请。
当事人对处理决定不服的，可在收到处理决定通知之日起15日内向上一级处理机关申请复议。
上一级处理机关接到复议申请后，应在3个月内作出复议决定。
当事人对复议决定不服的可在接到复议决定通知之日起15日内向人民法院起诉。

《中华人民共和国行政复议法》第三十条
公民、法人或者其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其已经依法取得的土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的，
应当先申请行政复议；
对行政复议决定不服的，可以依法向人民法院提起行政诉讼。