若保险公司以投保人或被保险人患有先天性畸形为由，拒绝承担与其有关的保险责任时，建议您采取以下步骤来维护自身权益并争取合理赔偿：
首先，务必全力搜集相关证据，包括但不限于原始医疗病历、保险合同文件、缴费单据及事故报告等等，以此证实申请人确实身患先天性畸形以及此种畸形与保险事故存在直接且必然的关联性。
其次，您需要认真研读投保时签署的保险条款，尤其要关注保险责任范围、责任免除事项、理赔流程等关键内容，以便准确理解保险公司拒绝赔偿的依据是否合法合规。接下来，寻求专业律师的意见和建议，深入了解自身所享有的权利和应尽的义务，以及可能面临的法律风险和后果。
最后，您可向具有管辖权的人民法院递交诉状，同时附上相关证据材料，正式启动诉讼程序。在诉讼过程中，请严格遵守法院的各项规定，积极参与庭审活动，提供有力的证据支持，并展开充分的辩论。最终，法院会根据案情的实际情况做出公正裁决。

《中华人民共和国保险法》第十六条
订立保险合同，保险人就保险标的或者被保险人的有关情况提出询问的，投保人应当如实告知。
投保人故意或者因重大过失未履行前款规定的如实告知义务，足以影响保险人决定是否同意承保或者提高保险费率的，保险人有权解除合同。
前款规定的合同解除权，自保险人知道有解除事由之日起，超过三十日不行使而消灭。自合同成立之日起超过二年的，保险人不得解除合同；发生保险事故的，保险人应当承担赔偿或者给付保险金的责任。
投保人故意不履行如实告知义务的，保险人对于合同解除前发生的保险事故，不承担赔偿或者给付保险金的责任，并不退还保险费。
投保人因重大过失未履行如实告知义务，对保险事故的发生有严重影响的，保险人对于合同解除前发生的保险事故，不承担赔偿或者给付保险金的责任，但应当退还保险费。
保险人在合同订立时已经知道投保人未如实告知的情况的，保险人不得解除合同，发生保险事故的，保险人应当承担赔偿或者给付保险金的责任。
保险事故是指保险合同约定的保险责任范围内的事故。