若车辆未能按期进行年度检查并因此发生了交通事故，保险公司无权以此作为免除其赔偿责任的理由。在保险合同中，如果保险公司并未明确告知客户车辆逾期未检便可能引发拒赔后果，那么在此情况下，保险公司仍有义务对客户的经济损失进行赔偿。
然而需要注意的是，根据现行法律法规，驾驶人员在未获得相应驾驶资质或处于醉酒状态时，以及被保险机动车在遭窃抢期间内发生交通事故，或者由于被保险人故意行为所致的交通事故等情形，由此造成的受害者财产损失，保险公司将不予承担赔偿责任。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十二条
有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：
（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；
（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；
（三）被保险人故意制造道路交通事故的。
有前款所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。