工伤补助的发放通常会根据不同情况来进行，具体如下：
1.工伤医疗待遇：当职工因工作遭受事故伤害或者患职业病而需要进行治疗时，可享受工伤医疗待遇。
治疗工伤所产生的费用，只有在符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录以及工伤保险住院服务标准的情况下，才会从工伤保险基金中予以支付。
例如，使用目录内的药品费用能得到报销。
2.停工留薪期待遇：在停工留薪期内，职工原工资福利待遇保持不变，由所在单位按月支付。
一般来说，停工留薪期不超过12个月。
若伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认后，可以适当延长，但延长时间不得超过12个月。
3.伤残补助待遇：劳动能力鉴定后，职工会根据鉴定等级享受相应的伤残津贴等补助。
像一次性伤残补助金等补助，会按照规定的标准由工伤保险基金支付。
总之，工伤补助发放需依据工伤认定、劳动能力鉴定等相关程序和规定，切实保障工伤职工合法权益。

案情回顾:

小朱在工作中受伤，治疗时使用了部分不在工伤保险药品目录内的药品。停工留薪期结束后，单位认为小朱伤情不严重不应延长，小朱认为应延长。劳动能力鉴定后，小朱对伤残补助金额有异议，认为发放不合理。

案情分析:

1、对于小朱治疗使用的不在目录内药品费用，按照规定，不符合工伤保险药品目录的费用不能从工伤保险基金中支付。
2、关于停工留薪期延长问题，小朱伤情若未达到严重或特殊情况，且未经市级劳动能力鉴定委员会确认，单位可不批准延长。
3、伤残补助待遇是按鉴定等级和规定标准发放，若小朱的情况符合规定标准，应按标准执行，不存在不合理问题。