电动自行车超标的惩罚措施如下所述：
1.如果违法者能够出示合法的购车凭证（由税务机关开具的发票），且其所购买的电动自行车符合国家相关质量标准但尚未完成注册登记手续，则将依法发出一份简易处罚决定书，并处以50元人民币的罚款。
然而若违法者拒绝缴纳罚款，则将依法对该车辆进行扣押。
2.对于持有摩托车驾照却驾驶未经注册登记的超标电动自行车的行为，将被扣除12分，同时还需缴纳200元人民币的罚款。
而对于没有摩托车驾照却驾驶未经注册登记的超标电动自行车的行为，驾驶人将会面临拘留的处罚。
3.如果违法者拒绝或阻碍交通警察依法履行职责，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定以及违法情节的严重程度，将可能受到罚款或者行政拘留等处罚；如涉及到犯罪行为，将依法追究其刑事责任。

《道路交通安全法》第九十九条
有下列行为之一的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款：
（一）未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的；
（二）将机动车交由未取得机动车驾驶证或者机动车驾驶证被吊销、暂扣的人驾驶的；
（三）造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（四）机动车行驶超过规定时速百分之五十的；
（五）强迫机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规和机动车安全驾驶要求驾驶机动车，造成交通事故，尚不构成犯罪的；
（六）违反交通管制的规定强行通行，不听劝阻的。