车罚款在网上交还会扣分。对于既有扣分又有罚款的违章处罚，必须先去交警队确认违章和扣分分数后，才能缴纳罚款。在网上只能处理200元以下的罚款，一次扣3分以下的。如果超出该范围，必须要到交警队服务大厅处理。

《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零八条
当事人应当自收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内，到指定的银行缴纳罚款。
对行人、乘车人和非机动车驾驶人的罚款，当事人无异议的，可以当场予以收缴罚款。
罚款应当开具省、自治区、直辖市财政部门统一制发的罚款收据；不出具财政部门统一制发的罚款收据的，当事人有权拒绝缴纳罚款。