对于交通肇事罪案件的二审撤销起诉问题，需要从多个角度进行全面深入的分析和考量。
通常来讲，在上诉程序中的一方有权提出撤销起诉的请求，但是，法院会对其申请进行深入细致的审查，包括审查申请撤销起诉是否基于其真正自愿且合法的意愿，同时还需要审视该行为是否会对国家利益、公共利益乃至他人的合法权益造成负面影响。
如果申请撤销起诉的理由符合相关法律法规及程序规范，那么法院有可能会批准这一申请；
然而，若存在任何不符合上述条件的情形，法院将无法予以批准。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百三十二条
【抗诉的方式】地方各级人民检察院对同级人民法院第一审判决、裁定的抗诉，应当通过原审人民法院提出抗诉书，并且将抗诉书抄送上一级人民检察院。原审人民法院应当将抗诉书连同案卷、证据移送上一级人民法院，并且将抗诉书副本送交当事人。
上级人民检察院如果认为抗诉不当，可以向同级人民法院撤回抗诉，并且通知下级人民检察院。