分居协议属于那种具有民事合同性质的文件。
在我们国家，一般合同要生效的话，通常都需要双方当事人达成一致的意见，然后签字确认等这些法定的要件才行。
要是其中一方没有签字，从那种特别严格的合同角度来考量的话，这个分居协议其实就还没有成立，自然也就没办法生效。
不过，如果可以有证据证明存在着双方实际上已经分居的这种状态，那就可以去收集一些相关的证据。
像双方分开居住的证据，像是租房合同，还有邻居们的证言之类的；
或者是一方已经搬离原来住所的证据等等。
当在涉及到离婚诉讼这类情况的时候，这些能够证明事实分居的证据，在一定程度上是可以当作双方感情已经破裂的一种佐证的，但要知道，这和分居协议生效可是完全不同的两个概念。
总而言之，分居协议要是只有一方不签字的话，确实是很难生效的，这时候就需要去寻找其他的途径来证明分居的事实。