如果当事人要申请公证子女抚养费的协议，需要由双方持以下材料亲自到公证处办理申请、等待审核、领取公证书等手续：
申请人双方的身份证、户口簿、离婚证、离婚协议；
小孩的户口簿、出生证；
双方协商好的抚养费协议书原件。

《公证程序规则》第十八条
自然人、法人或者其他组织申请办理公证，应当提交下列材料：
（一）自然人的身份证明，法人的资格证明及其法定代表人的身份证明，其他组织的资格证明及其负责人的身份证明；
（二）委托他人代为申请的，代理人须提交当事人的授权委托书，法定代理人或者其他代理人须提交有代理权的证明；
（三）申请公证的文书；
（四）申请公证的事项的证明材料，涉及财产关系的须提交有关财产权利证明；
（五）与申请公证的事项有关的其他材料。