双方当事人协商达成一致意见，子女抚养权协议书可以去公证处公证。
但若当事人就抚养权公证内容反悔的，可以向人民法院起诉。即经公证的民事法律行为、有法律意义的事实和文书，应当作为认定事实的根据，有相反证据足以推翻该项公证的除外。
子女抚养权协议书公证办理流程有：
1、向住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构提出公证申请。
2、填写公证申请表，并提交下列材料：自然人的身份证明，法人的资格证明及其法定代表人的身份证明，其他组织的资格证明及其负责人的身份证明；申请公证的文书；申请公证的事项的证明材料，涉及财产关系的须提交有关财产权利证明；与申请公证的事项有关的其他材料。
3、公证部门受理、并进行资料审查。
4、承办公证员拟制公证书，出具公证书。
5、送达公证书并签字。

《公证程序规则》第十七条，自然人、法人或者其他组织向公证机构申请办理公证，应当填写公证申请表。公证申请表应当载明下列内容：
（一）申请人及其代理人的基本情况；
（二）申请公证的事项及公证书的用途；
（三）申请公证的文书的名称；
（四）提交证明材料的名称、份数及有关证人的姓名、住址、联系方式；
（五）申请的日期；
（六）其他需要说明的情况。
申请人应当在申请表上签名或者盖章，不能签名、盖章的由本人捺指印。