平均进行分割。

男女双方共同出资，婚后买房，房产证有两个人的名字，但出资比例不同，如果没有特殊约定，由双方平均进行分割。在没有书面的特别约定的情况下，夫妻关系存续期间所得的财产属于夫妻共同财产。即使出资份额不同的，离婚时对于房屋也应该平均分配。

《民法典》第一千零六十二条
夫妻在婚姻关系存续期间所得的下列财产，为夫妻的共同财产，归夫妻共同所有：
(一)工资、奖金、劳务报酬;
(二)生产、经营、投资的收益;
(三)知识产权的收益;
(四)继承或者受赠的财产，但是本法第一千零六十三条第三项规定的除外;
(五)其他应当归共同所有的财产。
夫妻对共同财产，有平等的处理权。