并非所有在婚姻中分居长达两年的夫妇都将自动解除婚姻关系。
在某些情况下，如一方可以拿出充足的证据来证实双方确实因为感情不合而导致分居持续两年以上，且经过调解后仍无法恢复正常生活，那么法院有可能会批准离婚申请。
然而，若证据不足以支持这一说法，或者存在其他影响离婚判决的因素，那么法院也有可能不会做出离婚的决定。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。