在针对分居满两年提出的离婚申请中，通常需要提供以下相关证明文件：
首先，需提交由双方共同签署达成的分居协议，其中应当明确定义并阐述分居的具体意愿以及确实执行的时间段；
其次，相关的证据材料要充分展示出在分居后各位当事人所各自生活和栖息的具体地点，如房屋租赁合同、房地产证书等具有法律效应的证明资料；
第三，证人证言亦成为必须的证明事项之一，例如居住地的邻居或朋友等人能够见证你们夫妻关系的确处于分居状态；
最后，通信记录、电子邮件往来等信息也可以作为辅助性的证据来证实你们确实存在分居的事实情况。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。