在经过连续两年的分居之后向法院提请离婚诉讼请求，那么法院很大程度上会做出离婚的判决，然而这并不意味着该决定必定合法生效。
至于法院最终的判断结果会怎样，实际上取决于当事人之间的感情关系是否已经严重到无法愈合的地步。
若分居的原因仅仅是由于工作或学业等客观因素所导致，而并非感情出现裂痕，那么法院很有可能不会批准离婚申请。
然而，倘若能够提供充分的证据来证明双方确实因为感情问题而分居长达两年之久，并且经过调解也未能解决问题，那么法院通常会做出准许离婚的裁决。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。