在夫妇选择分居之后，申请办理离婚证书存在两种途径。
若双方能够就此达成共识，可以共同赴婚姻登记部门进行离婚登记。
在经过法律规定的30日离婚冷静期后，亲临该机构再次提交申请书以获取离婚证明书。
如果二人无法就此事妥善协商，或其中某一方坚决反对离婚，那么希望离婚的一方可向具有法律管辖权限的当地人民法院发起离婚诉讼请求。
在此过程中，法院将依据双方感情是否已经达到破裂程度等因素进行裁决。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。