商铺租赁协议发生纷争时，通常情况下应由合同双方共同努力协商以寻求妥善解决方案。若协商未能达成一致意见，可考虑通过司法途径诉讼方式，以期解决争议。在合同执行过程中，如因某方当事人主观原因而导致合同无法履行，需严格依据合同条款，向守约方支付相应的违约金并承担违约赔偿责任。对于违约金的赔偿金额，须参照商铺租赁协议中的相关规定进行裁定，若协议中有明确约定，则按约定金额赔付；反之，倘若约定金额不足以弥补守约方实际损失，守约方可申请法院酌情予以调整。若因不可抗力因素导致合同无法履行，原则上无需承担法律责任，但仍需尽快通知另一方当事人，以避免对其造成进一步的经济损失。

《中华人民共和国民法典》第五百九十条当事人一方因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但是法律另有规定的除外。因不可抗力不能履行合同的，应当及时通知对方，以减轻可能给对方造成的损失，并应当在合理期限内提供证明。当事人迟延履行后发生不可抗力的，不免除其违约责任。第五百八十二条履行不符合约定的，应当按照当事人的约定承担违约责任。对违约责任没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条仍不能确定的，受损害方根据标的的性质以及损失的大小，可以合理选择请求对方承担修理、重作、更换、退货、减少价款或者报酬等违约责任。