在处理农村地区的自建房屋纠纷时，首先应该由产生矛盾的两方面进行自我协商以寻求解决方式。若协商未果，可寻求所在辖区的村委会或社区办事处等第三方机构来协助进行调解工作。然而，若调解效果仍不尽人意，则应依法向法院提起诉讼，通过法律手段加以解决。其中，所谓“争议”，通常指因交易行为中的一方对另一方未能完全或者部分履行合同所约定之各项义务和责任而引发的商业纠纷。

《民法典》第二百三十三条物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。