关于房产所有权纠纷的问题，可以通过以下几种方式进行处理：首先，双方应该在确保公平公正且符合双方利益原则的基础上，进行适时的和解洽谈，如果无法达成共识，则可以请求一位公正客观的中间人进行调解；其次，如果之前所提到的两种方法都没能有效解决争议，那么当事人可以依据购房协议中事先约定的条款，将该项争议提交给有关仲裁机构进行裁决；最后，如果在仲裁过程中仍然有未能解决的问题，那么当事人就可以选择向当地人民法院提出诉讼申请，以期待得到更为全面和权威的法律支持与保护。

《中华人民共和国民事诉讼法》第三条
人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。