如若不慎遗失了农村自建房的准建许可证书，您可前往地方性的房屋及建设部门进行相应的补办手续。
在办理补发手续时，您需出示有效证件，包括个人身份证件以及房屋所有权证明文件等，随后需认真填写各项申请表格，按照既定流程提交所准备好的资料。
经过严谨审阅核验无误之后，便能够顺利申领新的准建许可证书。

《不动产登记暂行条例实施细则》第八十六条
房屋所有权依法发生转移，申请房屋所有权转移登记的，应当提交下列材料：
（一）登记申请书；
（二）申请人的身份证明；
（三）房屋所有权证书；
（四）宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
（五）证明房屋所有权发生转移的材料；
（六）其他必要材料。
申请村民住房所有权转移登记的，还应当提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。
农村集体经济组织申请房屋所有权转移登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。