对于在协议中约定违约责任为双倍租金的条款，这种做法通常被认为具有合理性。
然而，如果双倍租金远远超过了违约行为所导致的实际损失，那么主张减少这部分金额则是合法的。
依据相关法律规定，各方当事人有权利约定当其中一方违反合同约定时，应该按照违约情形向另一方支付相应的违约金；
同时，他们也有权约定因违约而产生的损失赔偿额的具体计算方式。
若约定的违约金低于实际损失，人民法院或仲裁机构将根据当事人的申请进行相应的调整和增加；
反之，若约定的违约金过高，超出了实际损失，人民法院或仲裁机构亦可根据当事人的申请对其进行适当的削减。
此外，若当事人在协议中就延迟履行义务设定了违约金，那么违约方在支付违约金之后，仍需继续履行其应尽的债务。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
【违约金】当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。