针对合同纠纷中关于买卖双方约定卖方违约时赔偿房屋部分价款比例为20%的法律效力问题，这需要从多个角度进行深入分析与评估。
首先，此类约定能否体现双方在签署协议当时的真实意愿，并且在整个过程中不涉及任何形式的欺诈或强迫行为，这是我们首要关注的焦点。
其次，我们还必须对这个违约金的具体金额进行全面的思考，不可过高也不宜过低。
如果违约金的设定远远超过了实际损失，那么违约方有权向法院或仲裁机构提出申请，要求适当降低违约金的数额；
反之，如果违约金的设定明显低于实际损失，那么非违约方则有权利要求提高违约金的数额。
在实际操作中，法院往往会依据实际损失作为基准，结合合同的执行状况、当事人的过错程度以及预期利益等多重因素，按照公平公正和诚实守信的原则来进行权衡与裁决。