一、经营规模不同：个人独资企业必须有固定的生产经营场所和合法的企业名称，属于一个小公司；
个体工商户可以没有企业名称，也可以没有固定的经营场所。
二、分支机构的设立：个人独资企业可以设立分支机构；
个体工商户根据规定是不可以设立分支机构的。
三、财务制度和税收政策不同：个人独资企业必须建立财务制度，进行会计核算；
个体工商户在是否建立会计制度上存在许多争议，如税务部门不作硬性要求，也可以不进行会计核算。
四、适用法律不同个人独资企业依照《个人独资企业法》设立；
个体工商户按照《民法》和《城镇个体工商户管理暂行条例》等规定设立。
五、承担责任不同个人独资企业投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任；
而个体工商户的债务如属个人经营的，以个人财产承担，如属家庭经营的，以家庭财产承担

《独资企业法》第31条
个人独资企业财产不足以清偿债务的，投资人应当以其个人的其他财产予以清偿。