当双方各自承担50%的责任时，保险赔偿一般会按以下步骤进行。
首先，双方的交强险会在其规定的责任限额内进行赔偿。
交强险的财产损失赔偿限额是2000元，这意味着在财产损失方面，最多可赔偿2000元；医疗费用赔偿限额为18000元，即医疗费用最多能赔付18000元；而死亡伤残赔偿限额为180000元，用于赔偿因事故导致的死亡或伤残相关费用。
超出交强险限额的部分，就需要根据双方的责任比例，由商业险来进行赔偿。
如果双方都购买了商业三者险，那么就按照事先约定的保险金额以及责任比例来分担赔偿责任。
举例来说，假如损失总额是10万元，交强险先赔偿2000元后，还剩下9.8万元。
因为双方各承担50%的责任，所以每人需承担4.9万元。
这4.9万元就由各自的商业险在其保险范围内进行赔付。
需要特别注意的是，实际的赔偿方式和金额并非固定不变，而是要依据保险合同的具体约定以及实际发生的情况来确定。
不同的保险合同可能在一些细节上存在差异，所以在进行保险理赔时，一定要仔细研究保险合同的条款，以确保自身的权益得到合理的保障。

案情回顾:

小朱与小李发生交通事故，经判定双方各承担50%责任。事故造成的损失总额达10万元。小朱和小李都购买了交强险与商业三者险。小朱认为交强险和商业险应按标准流程赔偿，小李则觉得应先查看保险合同特殊条款。这就产生了争议。

案情分析:

1、按照规定，交强险先在限额内赔偿，财产损失限额2000元，医疗费用限额18000元，死亡伤残限额180000元。本案件中，交强险先赔2000元后还剩9.8万元。
2、因双方各50%责任，剩余9.8万元每人承担4.9万元，这部分应由各自商业险按保险范围赔付，但需注意依据保险合同具体条款确定赔偿方式与金额。