1.通常来讲，当和营运车辆遭遇事故时，保险公司会依照保险合同的约定来进行赔付操作。
倘若你已经购置了交强险以及商业险，交强险会在其规定的责任限额范围内，对对方营运车辆所遭受的损失给予赔付。
而商业险则会按照保险条款中针对营运车辆的相关规定，去判定是否进行赔付以及赔付的范围大小。
2.不过，要是营运车辆出现了违法违规的行为，像是超载、未按时进行年检等情况，保险公司很可能会依据合同条款来决定是否免责或者进行部分免责。
3.因此，到底是否会赔付以及赔付的金额等诸多细节问题，都得依据保险合同的具体条款以及事故的实际情况来进行确定。
如果对于保险公司的赔付存在疑问，那么就应当及时与保险公司进行沟通交流，或者寻求法律专业人士的帮助，以确保自身的合法权益能够得到妥善的维护。
案情回顾:
小朱驾驶的车辆与小李运营的车辆发生交通事故。小李的运营车存在超载情况。小朱已购买交强险和商业险，小朱向保险公司申请理赔，保险公司以小李车辆超载为由，对商业险部分拒赔，小朱认为不合理，双方产生争议。
案情分析:
1、交强险应按规定对小李运营车损失在责任限额内赔付。
2、对于商业险，保险公司若能证明保险条款中有针对营运车辆超载免责或部分免责的规定，且已尽告知义务，拒赔可能合理，小朱若不服可通过查看合同条款、与保险公司沟通或寻求法律帮助来解决。