在福建起诉云南的对方时，通常要按以下步骤来操作：①明确管辖法院：一般来说，管辖法院为被告住所地，或者合同履行地等有管辖权的地方。
倘若合同中已经约定了管辖法院，那就按照约定去执行。
比如，被告在云南的某个特定地区，那通常就是该地区的法院有管辖权。
②准备起诉状：这是起诉的重要文件，要清晰地写明诉讼请求，比如要求对方赔偿多少金额、承担怎样的违约责任等；还要详细阐述事实与理由，把纠纷的来龙去脉说清楚，同时附上相关的证据材料，像合同、聊天记录、转账凭证等，以证明自己的主张。
起诉状中必须明确双方的基本信息，如姓名、身份证号、联系方式等，以及纠纷的具体情况，包括发生的时间、地点、经过等。
③提交材料与缴费：将准备好的起诉状及证据等材料一并提交给确定的法院，并且按照法院的要求缴纳诉讼费。
这是启动诉讼程序的必要费用。
④法院审查与立案：法院收到提交的材料后，会进行严格的审查。
如果符合立案条件，法院就会予以立案，并及时通知双方参与诉讼进程。
在诉讼过程中，双方都必须依法行使自己的权利，履行自己的义务，严格遵循诉讼程序的规定。
只有这样，才能保障自身的合法权益，让诉讼程序顺利进行下去。

案情回顾:

小朱在福建欲起诉在云南的小李，合同约定被告住所地云南某地区法院有管辖权。小朱备好起诉状，写明赔偿金额、违约责任等诉求，附合同、聊天记录等证据，提交材料并缴费。但小李认为该合同约定的管辖条款无效，双方就此产生争议，法院开始审查。

案情分析:

1、关于管辖法院的确定，合同约定通常优先。本案中小朱依据合同约定选择云南某地区法院起诉，若该约定符合法律规定，法院管辖权应无问题，需审查约定是否有效。
2、小朱准备的起诉状及证据等材料，应符合法律要求，清晰全面地阐述诉求和事实，以便法院准确了解案件情况。
3、在小朱提交材料并缴费后，法院审查期间，双方应遵循法律规定，依法行使权利、履行义务，推动诉讼程序正常开展。