网约车合作协议纠纷的处理方式较为多样。
其一，双方应首先尝试友好协商。
这就像是两个朋友在商量事情一样，大家坐下来，心平气和地把各自对于合作协议的理解、权利和义务都讲清楚，努力达成一个双方都能接受的和解协议。
这样既能避免矛盾的进一步激化，又能快速解决问题。
若协商无果，就可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。
在诉讼过程中，一定要明确合同中所约定的各项条款以及各方的行为是否符合法律规定。
法院会秉持着公正、公平的原则，根据实际的事实情况以及相关的法律条文进行裁判。
裁判结果可能是要求继续履行协议，让双方按照原来的约定继续合作；
也可能是解除协议，终止双方的合作关系；
还可能是判决一方赔偿另一方的损失，以弥补对方因纠纷而遭受的经济损失。
此外，还可以申请仲裁。
仲裁机构会依照专门的仲裁规则以及相关的法律来作出裁决。
总之，处理网约车合作协议纠纷时，要根据具体的实际情况，灵活选择合适的解决途径，这样才能有效地维护自身的合法权益。
并且，在整个过程中，一定要注意保留好相关的证据，比如协议文本、双方的沟通记录等，这些证据就像是我们的“武器”，在纠纷解决的过程中能够为我们提供强有力的支持。
案情回顾:
小朱和小李签订了网约车合作协议。在合作过程中，小朱认为小李未按协议履行义务，如出车时长不足。小李则称是车辆故障等客观原因导致。双方争执不下，未能通过友好协商解决争议，小朱欲通过法律途径解决。
案情分析:
1、双方协商不成后，小朱可向有管辖权的法院提起诉讼。诉讼时需明确协议条款和双方行为是否合法，法院会公正裁判，可能要求继续履行、解除协议或判一方赔偿另一方损失。
2、小朱也可申请仲裁，仲裁机构会依仲裁规则和法律作出裁决。小朱要注意保留协议文本、沟通记录等证据来维护自身权益。