违约金的计算方法通常是根据本金数额与违约比例来确定。
例如，您所提及的状况中，本金数额为人民币一万元整，违约比例设定为百分之三。
那么，应具体执行以下计算步骤：
10000×3%=300（元）这就意味着，以一万元作为基数，按照百分之三的违约比例计算得出的违约金结果即为人民币三百元。
然而，需要特别强调的是，关于违约金的约定及计算必须严格遵循相关的法律法规以及合同中的具体规定。
如果出现明显不公或其他特殊情况，有可能会面临调整的风险。