通常来讲，两份合同之中往往只有一份会被盖章，而通常是这份盖章的合同会生效。
合同能否生效，并非单纯由合同的份数来决定，关键在于是否满足法定的生效要件。
盖章作为合同生效的一种常见方式，倘若合同明确规定以盖章作为生效条件，并且仅仅只有一份合同进行了盖章，那么在符合其他生效要件的前提下（例如当事人具备相应的民事行为能力，合同内容不违背法律法规等），一般来说这份盖章的合同是会生效的。
然而，倘若合同约定的是双方签字或者盖章后合同才生效，仅仅只有一份合同盖章的话，就可能会存在效力方面的瑕疵，这就需要结合具体的合同条款以及实际情况来进行判断。
总之，我们不能一概而论地认为只有一份盖章的合同就肯定会生效或者肯定不会生效，一定要根据具体的情况进行具体的分析。

案情回顾:

小朱和小李签订合同，约定双方签字或盖章后合同生效。他们共准备了两份合同，但只在其中一份合同上盖了章。之后双方对这份盖章合同是否生效产生争议，小朱认为盖章合同应生效，小李觉得不符合双方约定，不能生效。

案情分析:

1、合同约定双方签字或盖章后生效，仅一份盖章不符合约定形式。
2、需考虑是否存在其他影响因素，如当事人是否有民事行为能力、合同内容是否合法合规等，综合判断盖章合同的效力。