若是所长手下职员有借款未偿还之情形，可依照《中华人民共和国民法典》第六百七十五条与第六百七十六条进行妥善处理。
首先，根据第六百七十五条之规定，若借款事项已明确约定了还款期限，则借款人应严格遵守约定，按期归还借款。
若借款期限尚未约定或约定不明晰，借款人有权随时履行还款义务；
而贷款方亦可通过催告方式，请求借款人在合理期限内予以偿还。
若借款人未能按照约定的期限归还借款，根据第六百七十六条之规定，借款人需按照约定或参照国家相关法律法规支付逾期利息。
在实践操作中，若所长手下职员发生借款后未及时还款的情况，可采取如下措施：
1.向借款人发送书面催收通知，要求其在合理期限内履行还款义务。
2.若借款人仍然拒绝还款，可依法向当地人民法院提起诉讼，请求判决借款人全额归还借款本息并支付逾期利息。
3.在诉讼过程中，可提交借款合同、银行转账凭证、催收通知等相关证据，用以证实借款事实以及借款人所负有的还款责任。
倘若借款合同中存在特殊的违约条款，例如逾期还款的利息计算方法、违约金等，亦可依据合同约定向借款人追讨相应的违约金或逾期利息。

《中华人民共和国民法典》第六百七十五条
借款人应当按照约定的期限返还借款。对借款期限没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定的，借款人可以随时返还；贷款人可以催告借款人在合理期限内返还。