在进行医疗司法鉴定的过程中，通常需要提交以下材料作为参考依据：
首先是患者的病历档案，涵盖了门诊病历、住院病历以及各种详细的检查报告等等；
其次，应当提供医疗费用支出清单，以便进一步核实医疗费用情况；
此外，还需准备好医患双方的陈述材料，以供专家组进行深入了解；
最后，相关的影像学资料，例如X光片、CT片等，也是必不可少的。
除此之外，如果有能够直接证明医疗损害结果的其他材料，例如伤残鉴定报告等，也应一并提交给鉴定机构。
值得注意的是，由于各个地区及鉴定机构的规定可能存在差异，因此具体所需材料可能会有所不同。

《司法鉴定程序通则》第十二条
委托人委托鉴定的，应当向司法鉴定机构提供真实、完整、充分的鉴定材料，并对鉴定材料的真实性、合法性负责。司法鉴定机构应当核对并记录鉴定材料的名称、种类、数量、性状、保存状况、收到时间等。
诉讼当事人对鉴定材料有异议的，应当向委托人提出。
本通则所称鉴定材料包括生物检材和非生物检材、比对样本材料以及其他与鉴定事项有关的鉴定资料。