分居四年的证明方式如下：1.双方签订书面分居协议：此协议需明确记载分居的起始时间以及其他相关事宜，它是证明分居的重要依据之一。
通过书面形式，将分居的细节固定下来，具有较强的法律效力。
2.一方的房屋租赁合同及租金凭证：若一方在外居住，其签订的房屋租赁合同以及缴纳租金的凭证能够清晰地体现出该方长期不在原居所居住。
这些凭证可以是租赁合同的原件、租金转账记录、收据等，它们能直观地证明分居的事实。
3.双方的书信、电子邮件等往来：在这些往来的信件或邮件中，如果有关于分居生活的内容，如描述各自的生活状态、对分居的态度等，也可作为分居的证明。
它们能从侧面反映出双方分居的情况。
4.证人证言：邻居、朋友等证人如果能够证明双方分居的事实，如看到一方长期不在家、了解双方分居的原因等，其证言具有一定的证明力。
但需注意，单独的证人证言可能效力较弱，最好与其他证据相结合，形成完整的证据链。
5.因感情不和分居满四年的相关证据：就医记录、报警记录等材料能够反映出夫妻关系紧张，可作为分居满四年的证据之一。
这些记录能直观地展示出双方在分居期间的生活状态和关系状况。
案情回顾:
小朱和小李分居四年后欲离婚，小李对分居四年的事实存疑。小朱拿出双方签订的分居协议，还有自己在外租房的合同及租金凭证，另有往来邮件提及分居生活，但小李认为这些证据不够充分，还质疑证人证言和相关记录的效力。
案情分析:
1、双方签订的书面分居协议明确记载分居起始时间等，是证明分居的重要依据，具有较强法律效力。
2、小朱的房屋租赁合同及租金凭证能直观体现其长期不在原居所居住，可证明分居事实。
3、往来邮件中关于分居生活的内容能侧面反映分居情况。
4、证人证言虽有一定证明力，但单独效力较弱，需结合其他证据。
5、就医记录、报警记录等能反映夫妻关系紧张，可作为分居满四年证据。