关于商铺租赁协议中涉及到的总面积和实际面积之间可能出现的差异问题，当这种差距在总计3%以内时，我们将依据实际情况来进行租金的结算。
然而，当这一差距超过了总计3%的上限时，承租方有权选择撤销这份租赁协议，而业主则有责任返还已经支付的所有租金款项以及对应的利息部分。如果承租方仍然愿意继续执行这份租赁协议，那么他们需要根据面积误差的具体比例以及双方事先约定好的价格来确定是否应该由承租方进行相应的补充、业主独自承担这部分费用、业主进行返还或者是双方共同承担并进行返还。

《民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。