公证能否跨区办理，需根据不同情况来确定：
一、一般情况
在通常情况下，公证需要遵循一定的区域规定来申请办理。
按照相关要求，应当向住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构提出申请。
这意味着，原则上是需要在特定区域的公证机构完成公证事宜的。
以房产公证为例，由于房产具有特定的地理位置属性，其相关的公证一般需在房产所在地的公证机构办理。
比如，某人在A市拥有一套房产，若要进行房产公证，那么他通常就需要前往A市房产所在地对应的公证机构提出申请，这样可以确保公证机构能够准确核实房产的相关信息，保证公证的真实性和有效性。
二、特殊情况
对于涉及不动产的委托、声明、赠与、遗嘱的公证，有相对灵活的规定。
这种情况下，可以适用住所地、经常居住地、行为地或者事实发生地的公证机构。
不过，需要注意的是，不同地区的公证机构可能会有不同的规定和操作流程。
因此，为了避免不必要的麻烦，在办理公证前，建议当事人先向相关公证机构咨询确认具体的办理要求。

案情回顾:

小朱在A市有房产，想办理房产公证，前往B市自己经常居住地的公证机构申请，公证机构以房产公证应在房产所在地办理为由拒绝。后小朱想办理该房产的赠与公证，再次向B市公证机构申请，又遇不同意见，引发争议。

案情分析:

1、对于一般的房产公证，按照规定应当向房产所在地的公证机构提出申请。小朱最初办理房产公证，B市公证机构拒绝是符合规定的，因为需确保准确核实房产信息，保证公证真实有效。
2、对于房产赠与公证这种特殊情况，可适用住所地、经常居住地等的公证机构办理。小朱再次申请时，B市公证机构应按特殊情况规定，结合当地具体流程考虑是否受理。