购房协议签字后一般情况下是生效的，下面为你详细分析：
一、从合同效力判定角度看
依据《民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时便生效，不过法律另有规定或者当事人另有约定的情况除外。
在购房协议中，只要是买卖双方真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫等违背真实意思的情形，且协议内容不违反法律法规的强制性规定，比如不得违反限购政策等，同时也不违背公序良俗，例如不能约定损害公共利益的条款，那么在双方签字之后，该购房协议通常就具备法律效力。
二、关于过户与合同效力关系
房屋过户是明确房屋所有权转移的登记手续，其主要作用是确定房屋所有权的归属。
即使因为一些客观原因，比如房屋存在抵押等情况暂时无法办理过户手续，这也并不会影响购房协议本身的法律效力。
买卖双方仍然需要按照协议中约定的各项条款，认真履行各自的义务。
三、特殊情况需注意
若在购房协议中明确约定，以房屋成功过户作为协议生效的条件，那么在房屋无法过户的情况下，该协议可能就不生效。
所以，在签订购房协议时，双方应仔细斟酌相关条款，避免不必要的纠纷。

案情回顾:

小朱与小李签订购房协议，小朱将房屋卖给小李，双方签字。但之后发现房屋存在抵押情况无法及时过户，小李认为协议未生效拒绝付款，小朱则认为协议生效要求小李履行付款义务，双方产生争议。

案情分析:

1、从合同效力判定角度看，此购房协议是双方真实意愿体现，不存在欺诈胁迫等情况，且不违反法律法规强制性规定和公序良俗，所以双方签字后协议通常生效。
2、关于过户与合同效力关系，房屋过户主要确定所有权归属，虽因抵押无法过户，但不影响协议效力，小朱应协助小李后续过户，小李也应按约定付款。
3、此案件不存在约定以过户为生效条件的特殊情况，所以协议生效，小李应履行付款义务。