购房违约金赔偿过了起诉时效的，守约方可以先与违约方协商解决，达成一致的赔偿意见，协商不成的，可以向法院起诉解决。
但是，因为购房违约金赔偿过了起诉时效，如果违约方提出来诉讼时效抗辩，守约方就丧失了该事项的胜诉权，法院对守约方要求违约方支付赔偿金的诉讼请求不予支持。

《民法典》第一百九十二条
诉讼时效期间届满的，义务人可以提出不履行义务的抗辩。
诉讼时效期间届满后，义务人同意履行的，不得以诉讼时效期间届满为由抗辩；义务人已经自愿履行的，不得请求返还。