在子公司终止运营并被注销后，相关合同将无法进行解除操作。
这是由于当子公司退出市场后，其将不再拥有民事权利能力，即丧失了开展各项民事活动的合法性和实效性。
依据我国相关法律法规明文规定，若子公司以自身名义从事各类民事活动，由此产生的民事责任均需由总公司的法人实体承担；
然而，也存在例外之情形，例如当子公司可用自身资产支付全部或部分民事责任时，如有不足则剩余部分仍需由总公司的法人实体承担。
因此，为避免日后出现不必要的纠纷与困扰，建议在子公司停业清算前完成所有相关合同的解除流程。

《劳动合同法》第三十六条
用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。