1.投资主体性质各异：
有限责任公司的投资主体的范围较大，既包括自然人，亦涵盖法人，而个人独资企业的唯一投资主体自然只能是单一的自然人，责任均须独自全权承担；
2.法律地位显明不同：
有限责任公司乃是法定的民事主体，依法享有且具备法人资格，然而个人独资企业则无此法定资格；
3.设立条件要求差异显著：
有限责任公司在注册资本方面的要求颇为严格，即需保证出资额不少于总注册成本的30％，但个人独资企业对此并无具体硬性执行规定；
4.税收缴纳法规规定有所区别：
有限责任公司需依照相关法规按时、足额缴纳企业所得税，而个人独资企业则无需为此类税费操心，仅需按所个体工商户可负担的水平来缴纳个税；
5.投资人承担之责各有千秋：
有限责任公司每位股东均应根据各自认购的出资额为限承担“有限责任”，而个人独资企业之投资人则须以其全部个人资产，对独资经营之公司承担无限责任。

《公司法》第三条
公司是企业法人，有独立的法人财产，享有法人财产权。
公司以其全部财产对公司的债务承担责任。
有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。