区别如下：
1、两者的产生方式不同；
执行董事系由股东会选举产生，总经理由董事会（或执行董事）进行聘任，并对董事会（或执行董事）负责。
2、两者的职权及作用不同；
总经理是董事会（或执行董事）聘任的，对董事会（或执行董事）负责，在董事会（或执行董事）的授权下，执行战略决策，实现董事会（或执行董事）制定的经营目标，并通过组建必要的职能部门，聘任管理人员，形成一个以总经理为中心的组织、管理、领导体系，实施对公司的有效管理。
执行董事由股东会选举产生，因此其代表的是股东会的利益，其主要是对企业战略发展负责。

《中华人民共和国公司法》第四十六条
董事会对股东会负责，行使下列职权：
（一）召集股东会会议，并向股东会报告工作；
（二）执行股东会的决议；
（三）决定公司的经营计划和投资方案；
（四）制订公司的年度财务预算方案、决算方案；
（五）制订公司的利润分配方案和弥补亏损方案；
（六）制订公司增加或者减少注册资本以及发行公司债券的方案；
（七）制订公司合并、分立、解散或者变更公司形式的方案；
（八）决定公司内部管理机构的设置；
（九）决定聘任或者解聘公司经理及其报酬事项，并根据经理的提名决定聘任或者解聘公司副经理、财务负责人及其报酬事项；
（十）制定公司的基本管理制度；
（十一）公司章程规定的其他职权。