涉嫌占有罪在管辖部门立案之后，通常会采取以下几种途径对涉案的违法款项进行追回：
首先是通过公安机关或者司法机关的全面调查以及强制收缴程序来要求嫌疑人主动归还他们所非法侵占的财物。
如果嫌疑人自愿积极配合，那么这无疑能够使其所受的刑事处罚程度得以适当减轻。
其次，在整个刑事诉讼过程中，受害者有权提起附带民事诉讼，请求犯罪嫌疑人对自己遭受的财务损失进行赔偿。
最后，倘若嫌疑犯拒绝偿还，法院在做出最终判决之时会依据相关法律规定，判定其必须进行退赔，并且通过强制执行等手段来确保追回被侵占的财物。

《中华人民共和国刑法》第二百七十条
【侵占罪】将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大，拒不退还的，处二年以下有期徒刑、拘役或者罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处二年以上五年以下有期徒刑，并处罚金。
将他人的遗忘物或者埋藏物非法占为己有，数额较大，拒不交出的，依照前款的规定处罚。
本条罪，告诉的才处理。